Σαφή θέση υπέρ της Ελλάδας πήρε ο πρόεδρος της Ευρωπαϊκής Επιτροπής Ζαν Κλοντ Γιούνκερ, ο οποίος καταδίκασε τη στάση της Τουρκίας και τις πρόσφατες εντάσεις που έχει προκαλέσει με την Ελλάδα και την Κύπρο.
Κατά τη διάρκεια συνέντευξης Τύπου την Τετάρτη με θέμα το νέο Πολυετές Δημοσιονομικό Πλαίσιο και τις επόμενες ευρωεκλογές, ο Ζαν Κλοντ Γιούνκερ, όταν κλήθηκε να σχολιάσει τις πρόσφατες εντάσεις, είπε: «Είμαι απόλυτα κατά της στάσης της Τουρκίας».
Την Τρίτη η Ευρωπαϊκή Επιτροπή έστειλε νέα προειδοποίηση προς την Αγκυρα ότι πρέπει να απέχει «από αρνητικές δηλώσεις που βλάπτουν τις σχέσεις καλής γειτονίας» και «από κάθε προστριβή, απειλή ή ενέργεια έναντι ενός κράτους-μέλους, διαταράσσοντας τις σχέσεις καλής γειτονίας και την ειρηνική επίλυση διαφορών».
Η Επιτροπή έχει επισημάνει, επίσης, «την ανάγκη να σεβαστεί η Τουρκία την κυριαρχία των κρατών-μελών σε ό,τι αφορά τη χερσαία επικράτεια, τα εθνικά χωρικά ύδατα και τον εθνικό εναέριο χώρο τους». Το σκάφος του ελληνικού Λιμενικού Σώματος που εμβολίστηκε από του τουρκικό είχε φτιαχτεί και με χρήματα των ευρωπαίων φορολογουμένων για την ασφάλεια των εθνικών και των ευρωπαϊκών συνόρων της ΕΕ, επισήμανε με νόημα η Κομισιόν.